要想使脱硫除尘器长期稳定、高效运行，就要对其容易产生的一些问题了解清楚，以下为我们多年来脱硫除尘器实践运行经验总结的，旋流脱硫除尘器容易产生的问题及解决办法。
1. 风机带水问题
　　 为了避免风机带水，一是使进入风机的烟气水蒸气未达到饱和状态，二是将脱硫除尘器放在引风机后，本设计风机放置在旋流板塔之后。为了保证烟气经脱硫除尘器后不发生带水问题，除在塔顶部安装了高效除雾板，使得烟气不带水滴外，同时对烟道采取适当保温处理，防止因烟气降温而导致的结露现象与风机带水。
2. 结垢和堵塞问题
　　 脱硫除尘器结垢与管路结垢问题，其机理基本相同，主要是晶相结垢，即沉淀物在管路内结晶，并形成晶核，逐渐晶体扩大，产生结晶堵塞。 
　　 钠钙双碱法采用易溶性的钠碱进行循环吸收，为清洁吸收。脱硫渣亚硫酸钙主国为絮状沉淀，脱硫液在循环池内经充分沉淀后Ca2+很低（约10-6mol/L）的清液，不易导致管道结垢；塔内由于吸收过后的亚硫酸氢钠更易熔于水，不会在塔内形成结晶、结垢。
　　 由试验分析，脱硫渣亚硫酸钙与粉煤灰均为易沉淀物质，试验过程亚硫酸钙沉淀时间约为20min，在循环池内2h可沉淀完全，可保证进入泵前池的脱硫液澄清；对于除渣过程带入泵前池的灰渣，由于数量较小，泵前池需定期进行除灰（每月一次）；循环水泵采用防腐耐磨水泵，能适用于浓度不高的微粒含量。

3. 废渣的处理
　　 脱硫渣的成分主要为粉煤灰与亚硫酸钙，亚硫酸钙以半水合的状态结晶出来。脱硫渣置于空气中会发生氧化，可直接拉到水泥厂作为水泥掺料或拉到混凝土搅拌站作为混凝土的配料综合利用。 
　　 脱硫渣与粉煤灰混合后可用于制砖，粉煤灰是一种火山灰质材料，主要成分是SiO2和Al2O3，它本身没有或略有水硬胶凝性能。在有水分存在、特别是在水热处理（蒸气养护）条件下，能与氢氧化钙或其它碱性氢氧化物发生化学反应，生成具有水硬胶凝性能的化合物。由于粉煤灰的化学成分与黏土相似，因此大量用来生产建筑制品，主要是粉煤灰砖。
4. 二次污染问题
　　 本工艺采用吸收液闭路循环的吸收方式，无废液二次排放污染；脱硫渣为钙盐，即使将其抛弃，也不会造成污染。 
5. 阻力损失问题
　　 旋流技术本身有导流作用，可以减低压降，在经过六年的实践测试表明，阻力损失与供水量有很大关系，供水量大时，每层旋流板阻力仅80Pa，一般供水情况每层阻力在50Pa左右，放流脱水装置的总阻力＜500Pa，全塔阻力为800Pa-1000Pa，是各类脱硫除尘器中阻力 小，也就是运行费用 的除尘脱硫一体化装置。